آنالیز بیوانفورماتیکی برهمکنش پروتئین-پروتئین | مفاهیم شبکه و پلاگین های Cytoscape

در این ویدئو به صورت کامل و کاربردی به آنالیز بیوانفورماتیکی برهمکنش پروتئین-پروتئین (PPI) می‌پردازیم. ابتدا با مفاهیم پایه شبکه، تعریف گره‌ها و یال‌ها در مطالعات زیستی آشنا می‌شویم و سپس ابزارهای پیشرفته‌ای نظیر MCODE برای شناسایی ماژول‌های عملکردی و خوشه‌بندی شبکه معرفی می‌شوند. همچنین مفاهیم مرکزیت در شبکه‌های زیستی مانند HUB، Degree Centrality، Stress Centrality، Eigenvector Centrality و Bottleneck Centrality به طور دقیق توضیح داده خواهند شد.

در ادامه، نرم‌افزار قدرتمند Cytoscape و پلاگین‌های کاربردی آن مانند CytoHubba، MCODE و yFiles معرفی شده و نحوه استفاده از این ابزارها برای تحلیل شبکه‌های زیستی ارائه می‌شود. این ویدئو مناسب پژوهشگران، دانشجویان بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی سیستم‌ها است که به دنبال یادگیری اصول و ابزارهای پیشرفته تحلیل شبکه‌های زیستی هستند.

🔗 موضوعات و ابزارهای مطرح‌شده در این ویدئو:

معرفی مفاهیم شبکه زیستی (گره و یال)
شناسایی پروتئین‌های HUB و تحلیل مرکزیت شبکه
استفاده از MCODE برای خوشه‌بندی و شناسایی ماژول‌های عملکردی
بررسی پارامترهای مرکزیت مانند Degree، Stress، Bottleneck و Eigenvector
آشنایی با نرم‌افزار Cytoscape و پلاگین‌های آن

🎯 این ویدئو و ویدیوهای بعدی را از دست ندهید اگر به دنبال یادگیری ابزارهای کاربردی بیوانفورماتیک هستید!

لینک دانلود Cytoscape و پلاگین‌ها در توضیحات موجود است.
امکان مشاهده لینک های تایید نشده وجود ندارد!

#‌بیوانفورماتیک #‌تحلیل_شبکه #‌پروتئین_پروتئین #‌شبکه_زیستی #‌Cytoscape #‌MCODE #‌yFiles #‌زیست_شناسی_سیستم‌ها #‌مرکزیت #‌ماژول_عملکردی #‌Bioinformatics #‌ProteinInteraction #‌NetworkAnalysis #‌FunctionalModules #‌HUBProteins #‌DegreeCentrality #‌StressCentrality #‌EigenvectorCentrality #‌BottleneckCentrality #‌CytoscapeAnalysis #‌SystemsBiology